Synthetic Biology
合成生物学是一门融合了生命科学观察分析方法和工程学设计思维的学科,使人类能够通过工程方法设计、改造甚至从头合成具有特定功能的生物系统。它是生物科学在21世纪出现的一个重要分支学科,最早在1911年《Science》杂志的两篇文章中被提出,2000年在学术刊物及互联网上逐渐大量出现,2004年被《Technology Review》评为将改变世界的十大新兴技术之一。
在合成生物学领域,先明确合成目标,涵盖特定化合物生产、生物电路构建或特定任务生物体设计等功能、特性与性能要求。随后挑选底盘生物,常见细菌、酵母、哺乳动物细胞等,需综合考虑生长、代谢及遗传操作特性。接着运用基因工程等工具设计构建基因线路或系统,选择合适基因元件并组合,可依生物学原理或经计算机模拟优化。最后优化设计,如调整基因表达、优化代谢途径、减少副产物以提升系统效率、稳定与可靠性,通过实验反馈完善方案。
依据设计方案进行基因合成,可采用化学或生物方法,化学法用于短片段,生物法可合成长序列或网络。然后利用如CRISPR-Cas9等技术将合成基因导入底盘生物编辑基因组。再通过基因克隆等把编辑后的基因组装成完整线路或系统并确保正确完整。最后培养并筛选构建好的生物系统或细胞,按实验需求优化培养与筛选条件以获取有功能的细胞或生物体。
对构建好的生物系统或细胞要进行功能验证,通过实验测定、生物传感器及成像技术等方法来确保其能达成预期功能,比如检测目标化合物产量、生物电路信号输出以及生物体表型变化等。同时要评估其性能,包括效率、稳定性、特异性、可重复性等,可通过比较不同构建体、不同条件测试、长期培养传代等方式进行。依据测试结果,可从调整基因表达水平、改变基因线路结构、优化培养条件等方面对生物系统或细胞进行优化改进,以迭代方式不断提升其性能与功能。