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STR细胞株鉴定

服务介绍  Service Introduction


             STR(Short Tandem Repeat,短串联重复序列)STR基因座由3~7个碱基对的核心重复单元串联而成,广泛分


布于人类基因组中,具有高度多态性,被视为细胞的“DNA指纹”。该标记可通过PCR技术进行扩增,其等位基因差异源自


核心重复序列拷贝数的不同。经毛细管电泳分离后,借助荧光检测即可获得分型图谱。最终,通过与权威细胞STR数据库


进行比对分析,可准确鉴定样品所属细胞系,或识别潜在的交叉污染来源。


服务优势  Service Advantages


        经验深厚国内率先实现全人源/小鼠细胞STR鉴定的机构,积累丰富案例。


        高分辨率采用18个小鼠位点与21个人源位点联合检测,鉴别力更强。


        结果可靠数据与国际标准数据库比对,经专家双重审核,保证准确性。


        高效交付1~48个样品仅需3~5个工作日、49~96个样本仅需4~7个工作日;

 

服务流程Technical Procedures



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小鼠细胞STR鉴定细胞株明细表(部分): List


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人源细胞STR位点信息: Info


下载


报告示例(部分): Sample Requirenments


 图层 2图层 4图层 5


资料下载


        IGE-细胞STR株鉴定委托书 



常见问题解答


1、请问做细胞STR鉴定有何用?


答:细胞STR鉴定主要应用于将人源细胞用于研究、生产的客户,包括但不限于以下领域:医学、遗传学、药物开发、疫


苗研制、生物技术和制药行业、再生医学、干细胞、肿瘤、免疫细胞治疗、病毒检测和治疗及基础细胞生物学等,通过细


胞STR鉴定,您可以:


<1>. 判断您培养的该细胞是否被其他细胞交叉污染及其可能被污染的细胞名称;


<2>. 明确知道自己正在使用的细胞是否“正确”——2015年有文献报道称:国内建立的人源细胞系竟有高达85.51%是错


的!


 

2、若我需要鉴定的细胞没有文献报道有STR数据,请问还能做STR鉴定吗?


答:尽管我司建立的STR数据库有目前最全的人源细胞系STR数据,但有些文献未报道STR数据的细胞系(国内自行建立的


细胞系)在我们数据库中可能也没有其STR数据。不过,我们仍建议您进行细胞STR鉴定,因为通过该项检测,您可以:


<1>. 判断您培养的该细胞是否被其他细胞交叉污染及其可能被污染的细胞名称;


<2>. 您将是第一个得到该细胞系STR数据(DNA指纹)的人;


<3>. 该细胞系的STR数据将保存在我们数据库中,方便您以后调用、比对。



3、我的研究结果发不了《Nature》,请问还有必要做细胞STR鉴定吗?


答:只要您使用细胞从事相关研究工作,我们强烈建议对您的细胞进行鉴定,原因如下:


<1>. 2015年有文献报道称:国内建立的人源细胞系竟有高达85.51%是错的!!!


<2>. 目前不止《Nature》需要细胞鉴定结果,很多杂志也陆续要求投稿者提供细胞鉴定数据;


<3>. 退一万步说,即使我们使用细胞的目的不是用来发表文章,如因为我们使用了“错误”的细胞或者被其他细胞污染的


细胞,而导致得出不可靠的实验结论,那多年的辛苦岂不白费、可惜?如2014年炒得沸沸扬扬的日本美女科学家小保方晴


子的STAP细胞闹剧,后来证实是污染了胚胎干细胞。


 

4、请问该如何送样测试?


答:为保证样品质量和STR鉴定效果,我们不建议客户直接送检自己提取好的基因组DNA。推荐客户直接寄送细胞沉淀,


方法:用PBS将细胞洗2遍后,收集细胞于一干净无菌离心管中,离心、去上清,即得细胞沉淀(细胞数≥106个,细胞沉


淀应至少肉眼明显可见),用封口膜封好离心管管口以防止样品泄漏及其他细胞污染。样品随冰袋寄送到我司即可。


 

5、请问贵司可以进行人干细胞系鉴定吗?


答:可以。目前我司的细胞系STR数据库包含2000来株人胚胎干细胞、hiPSCs、间充质干细胞系STR数据。


 

6、请问贵司的项目周期为多长?


答:1~48个样品,在确认收到样品及相应款项后3~5个工作日内完成鉴定;49~96个样品,在收到样品及相应款项后4~7


个工作日内完成鉴定工作。


 

参考文献:


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2. Capes-Davis, A., et al., Check your cultures! A list of cross-contaminated or misidentified cell lines.Int J Cancer, 2010. 127(1): p. 1-8.


3. Chatterjee, R., Cell biology. Cases of mistaken identity.Science, 2007. 315(5814): p. 928-31.


4. Lorsch, J.R., F.S. Collins, and J. Lippincott-Schwartz, Cell Biology. Fixing problems with cell lines.Science, 2014. 346(6216): p. 1452-3.


5. Neimark, J., Line of attack.Science, 2015. 347(6225): p. 938-40.


6. Zhao, M., et al., Assembly and initial characterization of a panel of 85 genomically validated cell lines from diverse head and neck tumor sites.Clin Cancer Res, 2011. 17(23): p. 7248-64.


7. Masters, J.R., Cell-line authentication: End the scandal of false cell lines.Nature, 2012. 492(7428): p. 186.


8. McLaren, R.S., Y. Reid, and D.R. Storts, Human cell line authentication: the critical first step in any project using human cell lines.Methods Mol Biol, 2013. 963: p. 341-53.


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11. Editorial, It is time for all involved to tackle the chronic scandal of cell-line contamination. Funders first.Nature, 2009. 457: p. 2.


12. ANSI/ATCC, Authentication of Human Cell Lines: Standardization of STR Profiling. 2011, ASN-0002-2011.


13. Masters, J.R., et al., Short tandem repeat profiling provides an international reference standard for human cell lines.Proc Natl Acad Sci U S A, 2001. 98(14): p. 8012-7.


14. Edwards, A., et al., DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats.Am J Hum Genet,1991. 49(4): p. 746-56.


15. Sorensen, T., A Method of Establishing Groups of Equal Amplitude in Plant Sociology Based on Similarity of Species Content and Its Application to Analyses of the Vegetation on Danish commons.Biol Skr, 1948. 5: p. 1-34.


16. Ye, F., et al., Genetic profiling reveals an alarming rate of cross-contamination among human cell lines used in China.FASEB J, 2015. 29(10): p. 4268-72.


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